Да, конфигурация занятная. Если взять основную площадку, то по форме и расположению относительно реки/переправы укрепление в Старой Котельне мне напомнило городище в Мазепинцах (Киевская обл.). Конфигурацию городища в Котельне усложняет вторая терраса, у которой очертание стремится к квадратному плану. Потому и возникла мысль - а не остатки ли это более позднего укрепления?
Для понимания того, что происходило на участке после гибели городища нужно понять, было ли оно включено в систему обороны позднее существовавшего городка, и если да, то когда всё происходило? К примеру, если в 1545-м городище всё ещё представляло собой пустырь (причём непонятно, были ли тогда у Котельни другие укрепления или она была простым селом), то в 17-м веке ситуация могла измениться.
Касательно "Короткого списка" - да, вполне возможно, что это нужный источник!