Возможно, что на момент создания карты Боплана замок уже был разрушен.
Мальченко О. Укріплені поселення Брацлавського, Київського і Подільского воєводств - С. 177
Мальченко ссылается: под №142 у него Археологическая карта Сецинского (правда не сверял страницы), под №177 карта Боплана, но под №115 у него Нейман Ц. Старая Брацлавщина и ее люди // КС. - К., 1889. - Т.27. - С.103-120 (ссылка на ст. 119).
Вот с последним источником очень интересно - в нем описано не только история гибели замка, но и интересная история его возникновения (источник есть в открытом доступе).
Оказывается замок был сооружен в качестве аргумента в земельном споре между Калиновским и Кохановским.
Привожу копии некоторых страниц:
Судя по этим описаниям городских укреплений не было - был только деревянно-земляной замок на острове. Так что у Боплана этот знак скорее всего означал таки город но в форме замка.